Как я синхронизирую подмножество таблиц между двумя базами данных по тому же mysql серверу базы данных

В зависимости от того, если Ваш MySQL 5.1 версии + я был бы Репликация предложения. Особенно рассматривая то, что Вы планируете иметь кластер в будущем.

Если бы Ваша конечная цель должна разделить серверы затем, я предложил бы выполнить отдельный экземпляр на другом порте и использовать стандартную репликацию между двумя

быстрый Google оказывается этим

альтернативно можно использовать триггеры для тиражирования, что-то вроде

CREATE TRIGGER replicatetable AFTER INSERT ON db1.table
  FOR EACH ROW BEGIN
    INSERT INTO db2.table(field1,field2, ...) values (db1.table.field1,db1.table.field2, ...);
  END;

подобный для ОБНОВЛЕНИЯ и УДАЛЯЮТ