Попробуйте удаленную интерактивную сессию:
http://wiki.imacros.net/How_to_Schedule_a_RemoteInteractive_Session
Вы шли в правильном направлении. у кота 5.5 connectionTimeout совпадает с keepalivetimeout у кота 6.0. но необходимо изменить значение от 2 до 2 000, как значение кота находится в миллисекундах, и апачское значение находится в секундах.
Вы правы, поскольку Вы не видите, что значение тайм-аута в http заголовках отправляет Вашим котом. но тайм-аут примет меры на стороне сервера. я предполагаю, что это не, отправляют, поскольку коннектором кота является HTTP/1.1 и Kee-Alive: timeout=X, max=Y
HTTP/1.0. как документация кота говорит, необходимо синхронизировать значения тайм-аута с обеих сторон, loadbalancer и кота в случае.