Нет никакой единственной утилиты к автоматически сценарию таблиц и всех данных.
Стандартное решение, которое я использовал бы для чего-то вроде этого, будет состоять в том, чтобы записать Сценарий SQL, чтобы обработать изменение данных, и затем скопировать базы данных со старого сервера и восстановить их к новому серверу, затем запустить Скрипт SQL.
Это - вероятно, не самое легкое решение, но этот способ, которым Вы, несомненно, перемещаете новейшие данные.
Вы не должны настраивать новый субдомен. Просто добавьте RR MX к mail.mydomain.com, указывающему на себя.