Вы не сказали при попытке какого-либо из существующих инструментов - и если они не подходили для некоторой цели.
Я запустил бы с загрузки любой многой командной строки инструменты генератора SHA и работу оттуда; проверьте, например, http://www.labtestproject.com/win/sha1sum.exe.html и для поколения и для проверки.
К вашему сведению, в Windows я по какой-то причине не мог заставить работать xargs, но это команда, которую я выполнил через оболочку Git Bash:
find . -name '*.php' -print0 | xargs -0 sed --regexp-extended --in-place 's/(require_once)/\/\/ \1/g'
Затем вручную повторно скопируйте Loader.php и Application .php, а не обработанные.