завершите работу mysql и просто возьмите резервное копирование mysql файлов базы данных - чтобы быть на безопасной стороне, берут все.
если Вы используете innodb, ДЕЙСТВИТЕЛЬНО БЕРУТ innodb файлы журнала также: ib_logfileX и innodb файл данных: ibdataX
предпочтительно примерьте другую машину, если данные читаемы, и затем мирно переустановите все это.