Perl AFAIK не нужно много ускорения - внутренне это работает совершенно по-другому по сравнению с Java или PHP.
Но если Вы вызываете жемчуг с помощью CGI, затем у Вас есть большие издержки там, к которым необходимо обратиться (используйте mod_perl или fastCGI), прежде чем код добирается до двоичного файла времени выполнения Perl.
Я полагаю, что лучшее ускорение для веб-сайта Perl - это использование одного из фреймворков Perl для его создания. Возможно, вы захотите увидеть Catalyst, Mojolicious или Dancer - они выглядят сейчас в топе и имеют хорошую поддержку сообщества.
Если ваш сайт все еще работает в CGI, может быть, пора перестроить его современным (и намного быстрее) способом?