Если Вы имеете в виду отпечаток пальца SSH RSA, чем он используется для проверки хоста, поэтому при принятии цифрового отпечатка однажды (необходимо проверить, является ли это реальное от машины), чем Вас предупредят, изменяется ли он. Чем Вы может избежать, например, человек в средних нападениях. По-моему, не имеет значения, какой отпечаток пальца используется, но RSA является видом стандарта на машинах Unix.