Я полагаю, что необходимо смочь сделать это с методом LimitRequestBody Apache.
Директива LimitRequestBody позволяет пользователю устанавливать предел для позволенного размера тела сообщения Запроса HTTP в контексте, в котором дана директива
...
Если, например, Вы разрешаете загрузку файла на конкретное местоположение и хотите ограничить размер загруженного файла к 100K, Вы могли бы использовать следующую директиву:
LimitRequestBody 102400