Вещи не всегда, чем они кажутся. Оказывается, что первопричиной была машина шлюза/брандмауэра для того VLAN. Это было оборудовано более старым nic, поддерживаемым eepro100 драйвером.
Я теперь заменил тот интерфейс SMC 9452TX, и проблема MTU больше не.
Спасибо все!
Я отправил этот вопрос в нескольких различных местах, ища ответ. Я наконец нашел его на сайте StackExchange Unix & Linux.
Я надеюсь, что это помогает кому-то еще там.