Не должно быть никаких проблем вообще с этим. Я просто проверил свой сервер SharePoint с порталом публикации как корень набора сайта и могу создать блог и подсайты Wiki без проблемы. Никакая потребность иметь отдельные наборы сайта. Где Вы сталкиваетесь с проблемами?
Наконец управляемый для нахождения решения. По некоторым причинам Это не должно связанных правильно в IIS. Удаление и повторное переплетение сертификата в IIS устранили проблему.