Memcached не сохраняет данные к диску. Ваше приложение должно использовать Memcached в качестве кэша а не для любого вида персистентности. Все данные должны быть в MySQL и таким образом, Ваша процедура резервного копирования не должна несколько отличаться. Если существуют важные данные, хранившие в Memcached, но не MySQL затем это - серьезный недостаток дизайна Вашего приложения.
Общий обзор Memcached от MySQL: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/ha-memcached.html