TrueCrypt для защиты Windows Server и веб-приложения
Сумма файлов в папке могла теоретически быть безграничной. Однако каждый раз, когда ОС получит доступ к определенной папке для поиска файлов, она должна будет обработать все файлы в папке. Меньше чем с 500 файлами Вы не могли бы заметить задержки. Но когда у Вас есть десятки тысяч файлов в единственной папке, простая команда списка папок (ls или dir) могла брать слишком долго. Когда к этим папкам можно будет получить доступ через FTP, это действительно будет слишком медленно...
Проблемы производительности не будут действительно зависеть от Вашей ОС, но от Вашей системной скорости процессора, емкостей диска и памяти. Если у Вас есть это много файлов, Вы могли бы хотеть объединить их в единственный архив и использовать систему архивирования, которая оптимизирована для содержания большого количества данных. Это могло быть zip-файлом, но еще лучше, сохранить их как блобы в базе данных с именем файла как первичный ключ.
Я думаю для любого крупномасштабного приложения, которое должно иметь дело с высокой загрузкой, это было бы плохой идеей, но если это является маленьким, это - прекрасное решение шифрования Ваши данные и выполнение Вашего веб-приложения от смонтированного диска TrueCrypt.
Путь TrueCrypt и подобная работа приложений полного шифрования диска скрывают слой шифрования от операционной системы / приложения и т.д. Существует небольшой хит производительности, поскольку каждый доступ к диску требует шифрования, или дешифруйте, но для низкого приложения загрузки это будет просто работать.
Небольшой протест был бы вокруг необслуживаемых перезагрузок - я предполагаю, что Вы только используете этот сервер, когда Вы находитесь на сайте, но если бы необходимо было использовать его удаленно, и отключение питания заставило его выключаться, то Вам было бы нужно физическое присутствие для запущения его снова.