Есть ли, возможно, ряд scriptmaps (включая подстановочный знак) на Прикладном уровне?
AFAIK:
Если бы Ваше приложение MVC было развернуто на http://server/, то Вам был бы нужен подстановочный знак на уровне сайта.
Если это развертывается на http://server/appdir/, Вам просто нужен он на appdir уровне.
Править: Все становится ясным... http://haacked.com/archive/2010/12/22/asp-net-mvc-3-extensionless-urls-on-iis-6.aspx - фильтр ASPNET_ISAPI может заботиться об этом с.Net 4.0. (Это также используется для обработки URL состояния сеанса без cookie в более ранних версиях - это просто стало более универсальным).