Mysql (и любой другой SGBD) пытаются загрузить большинство данных, возможных в памяти, потому что это - некоторые намного более быстрые для получения данных из RAM, чем жесткий диск.
Это - нормальное поведение на Linux (вероятно, большая часть Unix и возможно окон?) системы ведут себя как это. Больше Вы имеете в памяти, более быстрой выполнения программного обеспечения.