Смотрите на rsnapshot, это - просто сценарий, который можно использовать в качестве передней стороны для rsync. Это только скопирует материал, который изменил и поворачивает Ваши резервные копии.
Linux соглашается в основном с этим, таким образом, он мог бы работать. ОДНАКО возможно, что Вам нужны специальные драйверы для vps для работы правильно. Можно ли установить и выполнить ли какую-либо ОС на VM? Если так, затем, вероятно, возможно сделать. Будет лучше, если можно загрузить обе системы из изображения LiveCD, чтобы сделать копию.