Я думаю, что только с [NC] апач ищет файл, названный 'file.php? variable1= 1$ &variable2= 2$' (с переменной subsitued) на жестком диске. Можно попробовать [R, Северная Каролина] или [PT, NC] (эта потребность mod_proxy)
у нас была подобная проблема на testmachine после обновления nginx от 1.6.3 до 1.8.0. nginx журнал ошибок показал записи как
bind() to 0.0.0.0:80 failed (98: Address already in use)
bind() to 0.0.0.0:443 failed (98: Address already in use)
, мы решили его с
sudo fuser -k 80/tcp
sudo fuser -k 443/tcp
на производственной машине, мы остановили nginx перед обновлением.