Untangle является другой опцией с открытым исходным кодом, и она не требует никаких клиентских изменений. http://www.untangle.com/web-filter, например.
Вещи как ожидание на вводе-выводе не занимают процессорного времени, но могут заблокировать другие процессы от выполнения.
Возможно, у Вас есть процесс в бесперебойном сне (процесс указывают "D")?
Они действительно не способствуют для загрузки по сути, в то время как они спят, но они - постоянный процесс на очереди выполнения таким образом, загрузка искусственно расширяется.
Удачи