При монтировании конфигурационных файлов крона - действительно ли это возможно?

В чем Вы видите /var/log/cron? Это должно работать. Вы могли заменить связывание, монтируется с символьными ссылками, который является возможно простым решением. Это:

ln -s /mnt/persistent/conf/cron/cron.daily on /etc/cron.daily

Я не думаю, что в этой ситуации связывают монтирование, покупают Вас что-либо кроме сложности.

Далее отлаживать крон:

• Остановите свой сервис крона (/sbin/service crond stop).
• Выполненный крон с некоторыми флагами отладки, доступными с -x опция

Например:

crond -n -x pars

Это покажет детали о парсинге crontab. Некоторые из этих опций могут привести к полезной информации.