Я делаю это все время для кластеров MSCS на сервере ESX, и я уверен, что тот же основной прием мог быть применен к VMware Workstation.
На ESX я использую SAN/NAS NetApp, и я использую инструменты снимка NetApp для взятия снимка объема, которые VMs рассматриваемый идут. Затем я сделаю свой тест и выключу VMs снова и вернусь назад к предшествующему снимку NetApp.
Вы могли использовать бесплатный продукт, такой как OpenFiler, который поддерживает снимки момента времени, и сделайте то же. OpenFiler работает как VM.
Мешайте полномочиям наследоваться. Можно сделать это путем нажатия на Advanced на вкладку безопасности и снятия флажка для наследования.