Это кажется, что Вы просто планируете выполнить DNS на Windows Server, но не используете его для фактической обработки любого выравнивания нагрузки или направления трафика. В этом случае пока Ваш DNS правильно решает к серверу Linux, я не вижу проблемы. Samba не должен быть необходим, поскольку не кажется, что будет любая прямая связь, необходимая между Вашим Windows Server и сервером Linux.
Таким образом, я понял это...
1) Моя проблема, соединяющаяся с PuTTY, была то, вследствие того, что я пробовал к telnet к порту LDAP (OpenLDAP, или Windows не нравится он).
2) Проблемой с исходным сценарием Python были связанные полномочия. По-видимому, пользователь, не прочитавший полномочия на некоторых частях библиотек LDAP, заставляет python-ldap возвращать ldap. SERVER_DOWN неправильно.