Предположение, что у Вас нет проблемы блокировки файла (открытые файлы, Exchange, MS SQL, и т.д.), я рекомендовал бы rsync. Можно просто записать простой пакетный файл и запланировать его для выполнения Windows Scheduler использования ("при" команде). Если Вы ищете что-то, что имеет еще несколько функций (и может обработать Exchange), смотрите на Backula.
Это не идет в "просто работу", Вам будет нужен определенный applianance для этого. Мог бы работать на том же сервере, мог бы потребовать отдельной машины. Поиск решений для управления мобильными устройствами должен получить Вас на правильном пути....