Чтобы изменить пароль root для CentOS в EC2 с установленным в нем webmin, используйте следующую команду после входа в систему с помощью ssh.
/usr/libexec/webmin/changepass.pl /etc/webmin root <yourpassword>
после изменения пароля вы можете войдите в систему с новым паролем root в webmin, конечно, вы также можете войти в систему со своим ssh и личными ключами.