немного субдоменов решают, в то время как другие не делают

Предоставляется ли DNS домена более чем одним DNS-сервером? Возможно, у вас есть несколько DNS-серверов, конфигурация которых не совпадает. Таким образом, системы, получающие разные ответы в разное время, могут запрашивать разные серверы ...

Можете ли вы использовать 'dig' или что-то подобное для выполнения некоторых поисков вручную?

dig soa mydomain.com

должен включать список серверов имен (записи «NS» ).