Необработанная копия с точностью сектора на окнах
Можно хотеть взглянуть на основанный на доступе компонент Перечисления сервера Windows 2k3 (http://www.microsoft.com/windowsserver2003/techinfo/overview/abe.mspx), который скроет папки, к которым у Вас нет доступа.
Используйте компакт-диск LiveLinux по вашему выбору (например, Knoppix). Загрузитесь с него и выполните dd оттуда. Все остальное - просто взлом, если вы зависите от dd .
В противном случае вы можете выбрать любой инструмент для создания образов для Windows (например, Ghost, Acronis True Image).
С VirtualBox вы можете использовать VBoxManage clonehd , convertfromraw и storageattach , в зависимости от того, что подходит.
Для автоматизации вы можете использовать простую подготовку оболочки в Vagrant или, еще лучше, написать шаблон с Пакер . Установить их в Windows очень просто с помощью Chocolatey .