Удостоверьтесь, что nginx передает Тип контента: заголовок к браузеру правильно.
Internet Explorer полагается на заголовок Типа контента для обработки объекта применимо, пока WebKit/Mozilla/Геккон может интерпретировать содержание и сделать предположение на основе самого битового потока.
Одного GIT обычно недостаточно для обработки множества репозиториев с разными ACL. Обратите внимание на сторонние решения, такие как Gitosis или Gitolite.
http://blog.philippklaus.de/2011/06/install-gitosis-on-debian-squeeze/
На нашем сервере разработки мы используем Debian Сжать с помощью gitosis + redmine (apt-get install gitosis redmine).
Вы также можете использовать более комплексное решение, такое как Gitorius, но его не так просто установить.