Можно ли вставить вывод/var/log/messages, что, что Вы имеете, непосредственно перед тем, как сервер был перезагружен?
Не возможно узнать причину тупика, не проверяя файлы журнала.
Также тупик повторяется, или действительно ли это было то от события?
Параметр «Ограничения ISPI и CGI» используется только тогда, когда ASP.NET работает в классическом управляемом режиме конвейера (настройка для каждого пула). При работе в интегрированном режиме он не использует расширения ISAPI.
Вы можете отключить ASP.NET в сопоставлениях обработчиков, установив (отключив) права доступа к функциям.