случайная высокая загрузка ЦП на поле Linux

Невозможно определить место на диске. Вы можете включить все наборы журналов в mysql, особенно медленный журнал запросов «log_slow_queries» будет отображать запросы, выполнение которых занимает много времени, для дальнейшего мониторинга процесса mysql с помощью журналов.

Возможен случай, например, если ваше приложение получает огромные запросы, а mysql не может ответить и находится в очереди. Так что средняя нагрузка растет.

Вы можете найти [1] полезным.

[1] http://bit.ly/w2rPmz