Действительно ли возможно выполнить Apache VirtualHost на порте 443 с SSL прочь?

Определите то, что пользователь mysql выполняет как (я использовал бы ps aux |grep mysql, но Ваши флаги к PS могли бы отличаться), найдите, где mysql установлен (шоу шахты в результатах PS как --datadir=/usr/local/mysql/data, но Вам, возможно, понадобился бы Ваш экран, чтобы быть достаточно широкими, таким образом, он не усекает команду), и затем возвратите владение корректному пользователю.