DNS не может использоваться для определения портов. Поэтому не возможно сделать то, что Вы хотите, по крайней мере, не используя DNS. Это может быть достигнуто с помощью прокси-сервера или посредством перенаправления портов, но это может быть большей сложностью, чем Вы готовы к тому, если Вы - "не парень сервера".
RDS кажется лучшим выбором для вас, поскольку он полностью управляется Amazon, и вам не нужно беспокоиться о том, чтобы стать администратором баз данных, чтобы развернуть свое приложение.
Тем не менее, вы все равно должны хранить свои собственные резервные копии базы данных (например, с помощью mysqldump). Хотя это очень редко, Amazon терял данные клиентов в прошлом. Возможно, у вас никогда не будет этих 0,007% (или как бы там ни было на самом деле), но вы также хотите иметь какой-то план на случай, если вы это сделаете.