Вы попытались создать войну из каталога? И затем копируя пакет в '/usr/share/jetty/webapps' '-каталог.
Например.
jar cvf MyApp.war -C MyApp/ .
sudo cp MyApp.war /usr/share/jetty/webapps/
Надеюсь, это поможет!
Взгляните на Гагатовую Документацию, особенно примеры в руководстве новичка и объяснении WebAppDeployer, необходимо смочь настроить веб-приложение как ожидалось.
http://docs.codehaus.org/display/JETTY/Newbie+Guide+to+Jetty