MySQL отказывает один раз в ~24h
Тот же ответ как здесь:
Разрешение
Запустите экземпляр SQL Server в однопользовательском режиме или при помощи-m или при помощи-f опций. Любой член группы локальных администраторов компьютера может затем соединиться с экземпляром SQL Server как член фиксированной роли сервера системного администратора.
После того как Вы - на пути администраторское соединение (admin:localhost от SSMS, или -E -A от sqlcmd), добавьте себя к группе системного администратора:
CREATE LOGIN [domain\yourname] FROM WINDOWS;
EXEC sp_addsrvrolemember 'domain\yourname', 'sysadmin';
или сброс sa пароль:
ALTER LOGIN [sa] WITH PASSWORD = '...';
затем перезапустите сервер в нормальном режиме.
Я предполагаю (и это дикий удар в темноте с таким объемом информации) заключается в том, что задание cron запускается в одно и то же время каждый день и использует много памяти, поэтому Linux услужливо убивает некоторые другие процессы, использующие много памяти.
Проверьте свои журналы на наличие oom-killer .
Сколько у вас оперативной памяти? Сколько MySQL использует? Что еще работает на коробке?