Zip Veeam перестала работать с различными сообщениями об ошибках

Скорее всего, то, что происходит, - то, что Ваш процесс вращения журнала просит, чтобы mysql запустил новые журналы, но он на самом деле не поворачивает журнал медленного запроса в новый файл. Это могло быть то, потому что это установлено на минимальный размер журнала или просто не знает о файле. Документы MySQL имеют некоторую информацию о вращении журнала, но большинство дистрибутивов использует инструмент в масштабе всей системы для обработки всего вращения для всех различных серверов и журналов сразу. Например, использование Debian logrotate который настроен со списком mysql файлов журнала в /etc/logrotate.d/mysql-server