Благодаря входу от ответов до моего вопроса я смог отследить проблему к, он - причина. Случай был решен следующим образом:
Страница, которая не могла быть открыта (возврат только 500 или никакой ошибки вообще) была сценарием с помощью 'proc_open' и 'proc_close', который был отключен ASL.
Относительно того, почему не было никаких записей в журнале вообще, чтобы быть найденными связанными с проблемой в любых журналах, у меня еще нет ответа.
После вынимания двух функций из disable_functions директивы php.ini все было прекрасно.
Давным-давно Exchange / Outlook делал именно это. Затем Microsoft поняла, что это дыра в безопасности, и изменила ее на текущее поведение.