Я рекомендую Вам эту полезную страницу о большом количестве контролирующих инструментов:
http://en.wikipedia.org/wiki/Network_monitoring_comparison
Так или иначе я использую zabbix frotend Nagios для серверов, но я думаю, что Centreon (http://www.centreon.com/) стоит смотреть :)
Используйте одно из следующих средства ведения журнала портов: