Действительно ли необходимо контролировать PID процессов?

Кроме того, Ваш текущий .htaccess файл не включает файлы, он только устанавливает включать путь это использование php. Так, вообразите это дерево файла:

root
| - a
|   |- myphp.php
| - b
|   |- myinclude.extension

Когда Вы включаете в php файл myphp.php, обычно Вы сделали бы это:

<?php include('../b/myinclude.extension'); ?>

Но после установки

AllowOverride All php_value include_path "root/b/"

только необходимо ввести

<?php include('myinclude.extension'); ?>

но это действительно не имеет большое значение, не делает этого? Прочитайте страницы php.net о, включают, требуют и include_once, require_once.