Несколько опций приходят на ум:
Возможно взгляд на вывод cronjob код ошибки к журналу, ahve nagios смотрят на журнал. Если cronjob сообщает об ошибке, чем бум. Или, немного легче, но менее точный, имейте последнюю строку своего cronjob сценария, пишут в файл журнала. Имейте проверку nagios на дату модификации файла журнала. Если это идет больше чем 25 часов, начните предупреждение.