Я думаю, что Вы говорите, что "Совместное использование Полномочий" (и, возможно даже то, что папки были совместно использованы) не восстанавливается при восстановлении папок с помощью Backup Exec на машине Windows Server. Сообщите мне, неправ ли я.
Если Вы не восстанавливаете "Состояние системы" машины (в конечном счете для восстановления реестра), Вы не собираетесь возвращать связанные с долей атрибуты. Связанные с долей атрибуты для папки не хранятся в файловой системе, а скорее хранятся, поскольку реестр оценивает в HKLM\System\CurrentControlSet\Services\LanManServer\Shares. Восстановление папок не восстановит эту информацию в реестр сервера.