Ранее рабочая rsync операция, переставшая работать в недавнем обновлении Windows 8.1, показывающем “ошибку в сокете io”

Я не на 100% уверен, но я полагаю, что RAID-контроллер хранит конфигурацию RAID в специальном формате на самих дисках. Когда сервер загружается, пока он имеет все диски в нем, он должен смочь считать ту конфигурацию и продолжить ее веселый путь. Вам можно предложить во время начальной загрузки о том, принять ли конфигурацию, прочитанную дисков, но значение по умолчанию должно быть 'да'.