Если ничто не становится подаваемым, и фильтр isapi обнаруживается, как установлено и работает, то я думаю, что могла бы быть проблема в Ограничениях CGI и ISAPI. Удостоверьтесь, что коннектор позволяется.
Попробуйте это:
rewrite ^/the-directory/.+$ /the-directory/ permanent;
Вы застряли в цикле перенаправления, поскольку регулярное выражение ^ / the-directory / (. *) $
соответствует / the-directory /
.