Устранены обе проблемы.
Проблема перенаправления устранена путем удаления index.html или удаления в нем мета-тега обновления.
<meta http-equiv="refresh" content="0;url=mail/">
и введя несколько команд в терминале
# rm /etc/apache2/conf.d/roundcubemail.conf
# rm /etc/apache2/conf.d/cluebringer.conf
Перезапустите Apache:
# sudo service apache2 restart
Источник команд: https://www.digitalocean.com/community/questions/how-to-remove-iredmail
Для Webmin и нескольких других сетевых приложений это была проблема с IP-таблицами. iRedmail там что-то напортачил, поэтому я следил за этой статьей, и все вернулось в норму:
# sudo iptables -P INPUT ACCEPT
# sudo iptables -P FORWARD ACCEPT
# sudo iptables -P OUTPUT ACCEPT
# sudo iptables -F
# sudo iptables -X
Источник: http://www.prash-babu.com/2008/10/how-to-flush-or -remove-all-iptables.html