Это не ожидало поведения. Я протестировал бы пару других времен и видел бы, можно ли найти шаблон. Добавление пользователя через GUI никогда не должно удалять другого пользователя.
Вы изменяли наследование или очистку пользователь, который имел имя GUID или что-то еще одновременно? Или после создания доли, Вы 'перемещали' файлы? Перемещение от того же объема принесет исходные полномочия с ним и не наследуется.
Я подозреваю, что некоторый другой фактор помимо дополнения разрешения доли заставил это происходить.
Похоже, все работает, как и положено выскочке (я поместил свои файлы не в тот каталог!):
Я только что сделал следующее:
echo "manual" > /etc/init/atd.override
и вуаля - atd процесс больше не запускается при перезагрузке!