Проверьте свои pam настройки на ssh и su.
Например, для ssh:
auth sufficient pam_ldap.so
account sufficient pam_permit.so
также удостоверьтесь, что можно войти в систему через пароль в sshd_config
PasswordAuthentication yes
Также проверьте свои журналы: /var/log/auth.log