Вы могли сделать страницу, которая перестанет работать с ошибкой, когда это произойдет (попробуйте выгоду), затем используйте WCAT для моделирования различных условий загрузки. Надо надеяться, затем Вы видите шаблон или по крайней мере видите, является ли это связанная загрузка. Иначе я был бы, просто встроил что-то в клиент .NET, который ловит эту проблему и просто повторяет запрос, таким образом, это очевидно для пользователя.
Установка php5-dev пакет должна решить Вашу проблему. Можно найти эту информацию о http://packages.ubuntu.com/ с phpize5 (связанной автоматически с phpize)