Едва ли запросы обработаны по-другому для проксированных соединений в противоположность прямо к соединениям хоста.
У Вас есть несколько опций:
Если Вы используете Сервер FileZilla, то Вы не должны волноваться о IIS, так как Сервер Filezilla обрабатывает обслуживание файлов.
Я проверил бы, чтобы удостовериться, что ПАССИВНЫЙ FTP отключен на Киберутке клиент FTP. Также удостоверьтесь, что пользователь Сервера Filezilla читал/писал/изменял (или безотносительно доступа, который они должны иметь), доступ к рассматриваемому каталогу.
Можно хотеть обратиться к этому ресурсу также: http://wiki.filezilla-project.org/Network_Configuration
Что происходит, при попытке получить доступ к серверу локально от поля окон? Откройте My Computer и в типе строки поиска: ftp://username@your.ip.address. Это работает медленным?