Это не желательный подход вообще, из-за проблем безопасности...
Но, если Вы даете разрешения чтения к сервису, который выполняется appcmd
в файл applicationHost.config
файл, расположенный в %windir%\system32\inetsrv\config
каталог, Вы необходимо смочь выполнить a .bat
файл с appcmd
команды в нем от CruiseControl (по крайней мере, в моем случае).
Я сделал это на Сервере Сборки Windows Server 2008.