Сетевые решения для обновления для компании ~20 (5 локальных, 15 удаленных)?

Для mysql можно использовать mysqldump для дампа содержания базы данных в файл. Кроме этого, обычно только необходимо создать резервную копию файлов конфигурации (/etc и любые другие каталоги Вы изменили), любые другие каталоги данных, файлы журнала и список установленных пакетов. Необходимо смочь восстановить систему путем выполнения новой установки ОС, установки пакетов из списка и замены данных и конфигурационных файлов.