В то время как Вы зарегистрированы в сервер, можно запустить скрипт в отдельном режиме следующей командой:
nohup script >script.out 2>script.err &
Позже, когда Вы входите в систему снова, можно проверить script.out на любой вывод и script.err для любых сообщений об ошибках. Если Вы хотите выходные сигналы и сообщения об ошибках в том же файле, то сделайте:
nohup script >script.out 2>&1 &