rsync является стандартной утилитой для этого:
rsync -avz -e ssh source/ user@destServer:/dest/
rsync обычно идет с дистрибутивами Linux. Это также отвечает Вашему требованию не передачи вещей, которые не изменились.
Необходимо зарегистрироваться в Gmail для Бизнеса для этой функциональности, поскольку Вы довольно корректны, это должно поддерживаться Gmail.
Приложение: Поскольку другие указали, что можно сделать это бесплатно с Google Apps, если у Вас есть <50 учетных записей. Я не знал, что эта опция существовала.