Можно вручную установить владельца/opt/local/var/db/mysql5, это должен быть _mysql (по крайней мере, в моей установке)
Для приложения сторонних производителей. Я предпочитаю использовать Дискового директора Acronis: http://www.acronis.com/enterprise/products/diskdirector-server/