Много небольших файлов также будет более дорогим для записи в файловую систему, чем единственный большой файл. Это должно сделать вещи как:
Поскольку Вы получаете все больше файлов в каталоге, это может стать довольно дорогостоящим. И каждый из этих шагов может добавить, что задержка к копии обрабатывает и замедляет все это.
то, что Вы описываете, могло бы повредить условия лицензионного соглашения software+service.
используйте сетевой анализатор [например, wireshark] для анализа коммуникации между клиентским программным обеспечением и другой конечной точкой туннеля. так как они упоминают шифрование - это будет вполне трудное задание...